Protozoonlar hayvanlar aleminin tek hücreli ve en basit elemanlarıdır. 20.000 den fazla pro-tozoon cinsi bilinmektedir. Protozoonlar, 1) Sarcodina: Psödopodlar oluşturarak hareket eden ameboid protozoonlar (Entamoeba histolytica, Dientamoeba fragilis); 2) Siliaklar: Kirpiksi oluşumları olanlar (Balantidium coli); 3) Flajel-lalılar: Büyükçe ve kancaya benzer oluşumları olanlar (Giardia lamblia); ve 4) Sporozoa: Spor yapanlar (Plasmodiumlar) olmak üzere 4 sınıfta toplanırlar. Entamoeba histolytica, Diantamoeba fragilis, Balantidium coli ve Giardia lamblia insan için patojendir. İnfeksiyon genel­likle dışkı ile kontamine su ve besinlerin ağız yoluyla alınması ile bulaşır. Sanitasyon koşul­larının iyi olmadığı ülkelerde protozoon infeksiyonları daha sıktır.