Nisbeten daha nadir görülürler ve başlıca immünsüprese kişilerde (kemoterapiye ilişkili, steroid tedavisi, AİDS) görülürler, fakat bazı organizmalar, örn: Cryptococcus Neoformans, immünsüpresyon olmadan da hastalığa yol açabilir.

Hemotojen yolla (örn: Akciğerlerden, ki en sıktır) veya direkt (örn: Burun ve paranasal sinüslerden, ki nadirdir) yayılım görülebilir. Etken organizmalar:

• Cryptococcus neoformans: fungal menenjit
• Aspergillus: genellikle pulmoner infeksiyonunda eşlik ettiği fungal abseler
• Candida Albikans: fungal abseler
• Phycomycosis: tromboz ve ilişkili infarkt; sıklıkla kontrolsüz diabetikleri etkiler.