Etiyoloji muhtemelen multi faktöryeldir. Ülserler sıklıkla H.pylori, NSAİİ’ler ve stresle ilişkilidir. Daha az sıklıkla asid hipersekresyonu (örn:gastrinoma), infeksiyon, duodenal obstrüksiyon/intussepsiyon ve vasküler yetmezlik veya radyasyonla ilişkili ola­bilir.
Mekanizması tam anlaşılamasa da kronik gastrit etiyopatogenezinde, sigara içimi ve genetik predispozisyonun da rol oynadığı düşünülüyor.
Pathogeneznormalde üst GİS mukozası gerek özofagusun skuamöz epiteli gerekse de nötralizan bikar­bonat iyonları içeren aside rezistan mukus bariyeriyle
korunmaktadır. Asid ve pepsinin agressif etkisi mukozal protektif mekanizmalarla dengelenemediğinde peptik ülserasyon meydana gelir.
• Özofagial ülserasyon: En önemli nedeni korun­masız özofagus mukozasına asidik mide sekresyonun reflüsüdür.
• Duodenal Ülserasyon: En önemli faktör midenin asid hipersekresyonudur.
• Gastrik Ülserasyon: Pedispozan faktörler inkompetan pilordan regürjite olan safra, yüzey epitelinin H.Pylori infeksiyonu veya NSAİİ ile hasarını içerir.

Makroskopide peptik ülserler tipik olarak 1-2 cm çapta (çok daha büyük de olabilir) ve ülser kraterini çevreleyen keskin sınırlıdırlar.
Mikroskopik olarak, ülser krateri genellikle midenin muskularis propria tabakasına penetre şekildedir ve 4 histolojik zonu vardır.
• Süperfisiyal tabaka, fibrin ve inflamatuar exudadan oluşur.
• Fibrinoid nekroz tabakası
• Granülasyon tabakası
• Fibrozis

Ülserin tam iyileşmesi kas tabakasının fibrosisi ve üzerini epitel tabakasının kaplamasıyla olur. Klinik özellikleri epigastrik ağrı (antiasidlerle yatışır), bulan­tı ve kalp yanması (özofagial ülserlerde)dır.
Komplikasyonları ve şekilleri:
• iyileşmesi yavaş olmakla birlikte antiasid ajanlar ve mukozal koruyucularla hızlandırılabilir.
• Hemoroji: Üst GİS kanamasının sık nedenlerinden biridir.
• Adhezyon ve erozyon: ülser mide veya duodenum duvarını tüm katlarını erode eder ve ona yapışır.• Perforasyon: Ülser perfore olarak peritonit yapar.
• Fibröz striktürler: Özofagus peptik ülserasyonunda görülür, yara iyileşmesi sırasında oluşan fibröz doku, özofagus duvarında skarlaşmaya ve obstrüksiyona neden olur. Midede ülserler pilorik stenoza neden olabilir.
• Malign transformasyon (nadir)
Tedavisi:
• Yaşam tarzı değişikliği: Sigarayı bırakma, alkol alımını azaltma
• Medikal: H.Pylori eradikasyonu(antibiotikler),asid baskılanması(antiasidler,proton pompa inhibitörleri, H2 reseptör antagonistleri, vs.)
• Cerrahi: Parsiyel gastrektomi, vagotomi